A Real Madridtól az előző szezon végén elküldött Manuel Pellegrini lett a Málaga új vezetőedzője, a chilei 2013-ig írt alá a klubhoz.
Pellegrini a Villarrealnál lett ismert szakember, 2006-ban a Bajnokok Ligája elődöntőjébe vezette a csapatot, 2008-ban bajnoki ezüstérmet szerzett. A Real Madriddal klubrekordnak számító 96 pontot szerzett, így sem tudta megelőzni a bajnok Barcelonát.