Megvédte apjának, a június 4-én elhunyt Habsburg Ottónak az osztrák történelemről tett egy vitatott kijelentését legidősebb fia, Karl egy osztrák interjúban. A Kurier című napilap vasárnapi számában közölt interjúban Karl Habsburg kijelentette, egyáltalán nem tartja történelmi hibának, hogy apja 2008-ban egy II. világháborús megemlékezésen azt mondta: egyetlen európai ország sem mondhatja el több joggal magáról, hogy áldozat volt, mint Ausztria.

Az 1938. márciusi Anschluss - Ausztriának a náci Németországhoz csatolása - évfordulóján mondott szavai Ausztriában vitát váltottak ki, mert máig megoszlanak a nézetek arról, hogy mennyiben volt Ausztria áldozata, illetve mennyiben aktív részese az eseményeknek. Habsburg Ottó a parlamenti megemlékezésen arról is beszélt, hogy botrányosnaktartja az Ausztria áldozat vagy társtettes voltáról szóló vitát. "Kortársaktól soha nem is hallottam ezt a vádat, csak olyanoktól, akik nem élték át az akkori időket. Apám sok olyan emberrel találkozott, akik készek voltak meghalni Ausztriáért, megvédeni magukat, egyszerűen azért, hogy Ausztria fennmaradjon" - mondta Karl Habsburg az interjúban. "De ő ennél sokkal többet értett alatta. Azt, hogy volt sok osztrák, akik bűnrészessé váltak, soha nem tagadta, de ilyenek gyakorlatilag minden országban voltak" - tette hozzá.