Az általunk ismert életformák sejtjei örökítőanyagot tartalmaznak, amelyről az osztódás során másolat készül. Ez egy bevált és jól működő folyamat, de azért mindig becsúszhatnak hibák.
Az ilyen hibák kezelésének egyik mechanizmusa a DNS-törés által indukált replikáció (BIR vagy break-induced replication), ami összehegeszti az örökítőanyagot. Ez azonban rizikós folyamat, mert az összeillesztés során hibák kerülhetnek a DNS-be, amik például hosszú távon rák kialakulásához vezető mutációnak bizonyulhatnak.
Ez egy kétélű fegyver. A javítás képessége alapvetően jó, és bizonyos DNS-törések nem javíthatók másképp. A cél tehát jó, de a végeredmény rossz lehet
– magyarázza Anna Malkova, az Iowa Egyetem biológiaprofesszora. Malkova január közepén a Nature-ben publikált tanulmányában írta le a BIR működésének teljes folyamatát.
A tudomány eddig csak a folyamat kezdetét és végét ismerte pontosan. Ismert volt például, hogy a javítóapparátus egyfajta buborékot hoz létre a DNS sérülése körül, majd szétbontja az érintetlen szakaszokat, és új DNS-re másolja őket. Az Iowa Egyetem végzős diákja, Liping Liu által kifejlesztett Droplet Digital PCR nevű eljárással most végig tudták követni a folyamatot.
Képzeljen el egy vasútvonalat. Liping egy csomó állomást helyezett el a vonalon, és mindenütt nézte, hogy mi halad át. Mennyi DNS-többlet jelentkezett az egyes pontokon, és ebből összeállíthattuk a folyamatot
– mondja Malkova.
Mindez persze nem lett volna elég: a kutatócsoport az egyes állomásokon akadályokat képezett a folyamat előtt – például folyamatban lévő fehérjeátírást vagy telomér szekvenciát –, és megnézték, mi történik.
Kiderült például, hogy ha a folyamat már a kezdetnél egy folyamatban lévő transkripcióba fut (amikor a DNS-ben tárolt információ kiírása történik fehérjeelőállítás céljából), az egész javítás leáll. Az is feltűnt, hogy a későbbiekben a transkripció iránya és térbeli elhelyezkedése befolyásolhatja a javítás minőségét, ami fontos lehet a rák kialakulásában.
Tudtuk, hogy sok instabilitás van ott, ahol a gyakori átírás találkozik a replikációval. Eddig nem tudtuk, hogy mi okozza ezt a jelenséget
– mondta Malkova.
A probléma tehát ott keletkezik, amikor osztódás során folyamatban lévő átírásba ütközik a másolás.
A kutatásunk megmutatta, hogy a BIR ilyenkor siet segíteni, de az érkezése nagy árat követel. Ahol a BIR találkozik a transkripcióval, instabilitás kerülhet a rendszerbe, ami mutációkhoz vezet. Végeredményben: amiről azt gondoltuk, hogy a transkripció és a replikáció ütközése okozhatja a rákot, valójában a BIR közbelépése miatt történik. Menti a menthetőt, de kérdéses, hogy mennyit segít valójában
– emelte ki Malkova.